No hay noticias sobre su vida. Su propio nombre indica su procedencia. Algunos investigadores lo identifican con el patriarca monifisita de Antioquía (630-648).
Su identificación ha creado varios problemas que no han sido resueltos. De ahí que, por los fragmentos de la Excerpta Constantinii o de los del Códice Parisino (1763) de Salmasio, se hable de un segundo autor con el mismo nombre (Pseudo Juan de Antioquía), pero sin aclarar quién es el verdadero.